Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KHDC3LQ587J8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms