Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC93Q567U6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC93Q567U6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC93Q567U6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms