Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALFQ53S48 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALFQ53S48 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALFQ53S48 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ALFQ53S48 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALFQ53S48 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALFQ53S48 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms