Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC38Q502W7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC38Q502W7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC38Q502W7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms