Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GNPTABQ3T906 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GNPTABQ3T906 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNPTABQ3T906 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms