Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC5A9Q2M3M2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A9Q2M3M2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms