Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRF1Q16656 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRF1Q16656 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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