Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIC1Q15915 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIC1Q15915 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms