Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SS18Q15532 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SS18Q15532 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SS18Q15532 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SS18Q15532 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18Q15532 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18Q15532 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18Q15532 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18Q15532 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18Q15532 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18Q15532 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18Q15532 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18Q15532 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18Q15532 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18Q15532 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18Q15532 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18Q15532 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18Q15532 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18Q15532 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18Q15532 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18Q15532 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18Q15532 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18Q15532 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18Q15532 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18Q15532 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18Q15532 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18Q15532 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18Q15532 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18Q15532 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18Q15532 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18Q15532 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18Q15532 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18Q15532 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18Q15532 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18Q15532 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18Q15532 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18Q15532 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18Q15532 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18Q15532 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18Q15532 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18Q15532 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18Q15532 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18Q15532 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18Q15532 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18Q15532 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18Q15532 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18Q15532 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18Q15532 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18Q15532 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18Q15532 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18Q15532 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18Q15532 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18Q15532 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18Q15532 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18Q15532 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18Q15532 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18Q15532 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18Q15532 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18Q15532 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18Q15532 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18Q15532 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18Q15532 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18Q15532 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18Q15532 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18Q15532 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18Q15532 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18Q15532 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18Q15532 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18Q15532 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms