Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.074e-9■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 ACSL4-205ENST00000469857 506 ntTSL 1 (best)12.07□□□□□ -0.484e-9■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -14e-9■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 ACSL4-210ENST00000505855 587 ntTSL 45.27□□□□□ -1.574e-9■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 HERC1-214ENST00000561400 2215 ntTSL 213.26□□□□□ -0.298e-8■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 HERC1-209ENST00000560519 591 ntTSL 310.58□□□□□ -0.728e-8■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.498e-8■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 KNL1-203ENST00000526913 5584 ntTSL 1 (best)1.78□□□□□ -2.123e-6■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 ATF7IP2-205ENST00000535850 1907 ntTSL 211.76□□□□□ -0.532e-7■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.162e-7■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.272e-7■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 ATF7IP2-213ENST00000565616 610 ntTSL 36.64□□□□□ -1.352e-7■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.392e-7■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.462e-7■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 ATF7IP2-215ENST00000568027 3406 ntTSL 1 (best)5.77□□□□□ -1.492e-7■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.582e-7■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-7■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 RBM33-204ENST00000392755 552 ntAPPRIS ALT2 TSL 414.18□□□□□ -0.142e-7■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.142e-7■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.412e-7■□□□□ 9.7
SAFBQ15424 AP000561.1-201ENST00000444130 435 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.631e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC8.52□□□□□ -1.051e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.111e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 SLC30A6-208ENST00000454324 2359 ntTSL 25.59□□□□□ -1.511e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.551e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 SLC30A6-207ENST00000449777 2207 ntTSL 24.77□□□□□ -1.651e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.671e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.771e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.851e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC13.01□□□□□ -0.333e-9■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 214.01□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 512.37□□□□□ -0.433e-6■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)20.4■□□□□ 0.861e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)15.56■□□□□ 0.081e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 215.53■□□□□ 0.081e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -01e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 SMAP2-205ENST00000539317 2501 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.531e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.631e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.691e-7■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.042e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-231ENST00000557336 580 ntTSL 312.3□□□□□ -0.442e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 212.03□□□□□ -0.482e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.512e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-213ENST00000554891 644 ntTSL 511.8□□□□□ -0.522e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.552e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.612e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-209ENST00000554383 1039 ntTSL 511.09□□□□□ -0.632e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-218ENST00000555215 781 ntTSL 511.09□□□□□ -0.632e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-224ENST00000556226 629 ntTSL 510.95□□□□□ -0.662e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.662e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-216ENST00000555137 789 ntTSL 310.56□□□□□ -0.722e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.832e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.832e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-207ENST00000553614 604 ntTSL 59.85□□□□□ -0.832e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.832e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.892e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-212ENST00000554539 748 ntTSL 59.22□□□□□ -0.932e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.032e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-233ENST00000557768 599 ntTSL 36.11□□□□□ -1.432e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.772e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 HNRNPC-217ENST00000555176 531 ntTSL 53.81□□□□□ -1.82e-10■□□□□ 9.6
SAFBQ15424 INSIG2-203ENST00000467223 627 ntTSL 521.43■■□□□ 1.026e-8■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 INSIG2-202ENST00000411929 574 ntTSL 217.18■□□□□ 0.346e-8■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 INSIG2-206ENST00000485520 3185 ntTSL 512.47□□□□□ -0.416e-8■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 INSIG2-204ENST00000471186 2100 ntTSL 510.22□□□□□ -0.776e-8■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.926e-8■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.081e-6■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 GRB10-212ENST00000439044 733 ntTSL 525.37■■□□□ 1.652e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.42e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.292e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.112e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.032e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 GRB10-202ENST00000357271 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 GRB10-210ENST00000407526 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 GRB10-203ENST00000398810 4785 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 GRB10-209ENST00000406641 2700 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.762e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.82e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 FMO5-205ENST00000527849 2410 ntTSL 519.86■□□□□ 0.771e-6■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.71e-6■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.221e-6■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.861e-6■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -11e-6■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.921e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -11e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 TNRC6A-207ENST00000491718 7956 ntTSL 1 (best)7.49□□□□□ -1.211e-7■□□□□ 9.5
SAFBQ15424 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)29.98■■■□□ 2.393e-7■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.143e-7■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.693e-7■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 325.22■■□□□ 1.633e-7■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.613e-7■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 216.52■□□□□ 0.243e-7■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.22e-6■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 317.31■□□□□ 0.362e-6■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 314.45□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-8■□□□□ 9.4
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