Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 BDH1-214ENST00000479425 1144 ntTSL 214.46□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 34.5
SAFBQ15424 BDH1-213ENST00000477015 595 ntTSL 211.38□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 34.5
SAFBQ15424 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.891e-6■■■■■ 32.1
SAFBQ15424 BDH1-205ENST00000432819 955 ntTSL 521.77■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 32.1
SAFBQ15424 BDH1-209ENST00000446746 868 ntTSL 321.77■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 32.1
SAFBQ15424 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 32.1
SAFBQ15424 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 32.1
SAFBQ15424 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 32.1
SAFBQ15424 BDH1-206ENST00000434143 659 ntTSL 312.99□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 32.1
SAFBQ15424 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.597e-8■■■■■ 31.2
SAFBQ15424 PDE3A-202ENST00000542675 685 ntTSL 312.86□□□□□ -0.357e-8■■■■■ 31.2
SAFBQ15424 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.276e-10■■■■■ 30.3
SAFBQ15424 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 227.39■■□□□ 1.987e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.67e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.217e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.077e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 221.59■■□□□ 1.057e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-217ENST00000530337 741 ntTSL 319.48■□□□□ 0.717e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.347e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.337e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.227e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-215ENST00000529464 932 ntTSL 1 (best)15.77■□□□□ 0.127e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.087e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.167e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-204ENST00000525283 898 ntTSL 313.97□□□□□ -0.177e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-225ENST00000622850 1987 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.437e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.117e-10■■■■■ 30.1
SAFBQ15424 BLCAP-214ENST00000613961 4083 nt8.48□□□□□ -1.053e-9■■■■■ 29.9
SAFBQ15424 RPH3AL-218ENST00000575736 566 ntTSL 518.86■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 29.2
SAFBQ15424 RPH3AL-212ENST00000573780 531 ntTSL 415.27■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 29.2
SAFBQ15424 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 28.5
SAFBQ15424 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 28.5
SAFBQ15424 RPH3AL-221ENST00000577079 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.03■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 28.5
SAFBQ15424 RPH3AL-220ENST00000576420 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.21■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 28.5
SAFBQ15424 RPH3AL-215ENST00000574953 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.8■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 28.5
SAFBQ15424 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 28.5
SAFBQ15424 RPH3AL-219ENST00000576001 647 ntTSL 317.55■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 28.5
SAFBQ15424 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 28.5
SAFBQ15424 RPH3AL-214ENST00000574722 586 ntTSL 417.46■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 28.5
SAFBQ15424 RPH3AL-204ENST00000570638 537 ntTSL 517.46■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 28.5
SAFBQ15424 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.963e-9■■■■■ 28.4
SAFBQ15424 RRAS2-209ENST00000532950 888 ntTSL 325.19■■□□□ 1.623e-9■■■■■ 28.4
SAFBQ15424 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.273e-9■■■■■ 28.4
SAFBQ15424 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.273e-9■■■■■ 28.4
SAFBQ15424 RRAS2-207ENST00000531807 732 ntTSL 56.53□□□□□ -1.363e-9■■■■■ 28.4
SAFBQ15424 RRAS2-206ENST00000531421 497 ntTSL 55.47□□□□□ -1.533e-9■■■■■ 28.4
SAFBQ15424 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.533e-9■■■■■ 28.4
SAFBQ15424 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.683e-9■■■■■ 28.4
SAFBQ15424 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.73e-9■■■■■ 28.4
SAFBQ15424 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.93e-9■■■■■ 28.4
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SAFBQ15424 FBXL13-206ENST00000448002 2582 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.695e-9■■■■■ 27.5
SAFBQ15424 FBXL13-202ENST00000379305 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.715e-9■■■■■ 27.5
SAFBQ15424 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.035e-9■■■■■ 27.5
SAFBQ15424 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.065e-9■■■■■ 27.5
SAFBQ15424 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.485e-9■■■■■ 27.5
SAFBQ15424 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.765e-9■■■■■ 27.5
SAFBQ15424 TCERG1-202ENST00000394421 3633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.216e-9■■■■■ 27.2
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SAFBQ15424 TCERG1-215ENST00000515203 576 ntTSL 57.67□□□□□ -1.186e-9■■■■■ 27.2
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SAFBQ15424 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.842e-8■■■■□ 26.5
SAFBQ15424 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.692e-8■■■■□ 26.5
SAFBQ15424 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.642e-8■■■■□ 26.5
SAFBQ15424 SERINC2-204ENST00000491976 2807 ntTSL 219.05■□□□□ 0.642e-8■■■■□ 26.5
SAFBQ15424 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.352e-8■■■■□ 26.5
SAFBQ15424 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.183e-7■■■■□ 26
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SAFBQ15424 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 25.5
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SAFBQ15424 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 25.5
SAFBQ15424 HNF4A-209ENST00000619550 4763 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.352e-7■■■■□ 25.5
SAFBQ15424 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 25.5
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SAFBQ15424 AL669831.3-207ENST00000635509 941 ntTSL 510.25□□□□□ -0.774e-6■■■■□ 24.8
SAFBQ15424 BLCAP-206ENST00000411780 714 ntTSL 38.49□□□□□ -1.054e-6■■■■□ 24.2
SAFBQ15424 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.441e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.571e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.611e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.17□□□□□ -0.621e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-215ENST00000468376 4064 ntTSL 1 (best)11.02□□□□□ -0.651e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.751e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.771e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.831e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.841e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.851e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.931e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.941e-7■■■■□ 23.6
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