Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.544e-33■■■■■ 56.5
PCBP2Q15366 CTNNA1-237ENST00000523275 536 ntTSL 510.86□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 56.4
PCBP2Q15366 CTNNA1-230ENST00000521724 2741 ntTSL 29.26□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 56.4
PCBP2Q15366 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 56.4
PCBP2Q15366 CTNNA1-203ENST00000517534 416 ntTSL 27.62□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 56.4
PCBP2Q15366 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 56.4
PCBP2Q15366 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 56.4
PCBP2Q15366 CCNI-205ENST00000507788 595 ntTSL 416.03■□□□□ 0.164e-9■■■■■ 56.3
PCBP2Q15366 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.32e-9■■■■■ 56.2
PCBP2Q15366 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 56.2
PCBP2Q15366 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.362e-9■■■■■ 56.2
PCBP2Q15366 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.051e-10■■■■■ 56.1
PCBP2Q15366 BCL3-207ENST00000474300 819 ntTSL 215.96■□□□□ 0.151e-18■■■■■ 56.1
PCBP2Q15366 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 56
PCBP2Q15366 ACACB-202ENST00000377848 9247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 56
PCBP2Q15366 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 56
PCBP2Q15366 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 56
PCBP2Q15366 SSH1-208ENST00000548522 602 ntTSL 315.02■□□□□ -05e-7■■■■■ 56
PCBP2Q15366 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.455e-7■■■■■ 56
PCBP2Q15366 UBE2G1-203ENST00000571980 984 ntTSL 519.34■□□□□ 0.696e-9■■■■■ 56
PCBP2Q15366 UBE2G1-206ENST00000574633 863 ntTSL 218.93■□□□□ 0.626e-9■■■■■ 56
PCBP2Q15366 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.136e-9■■■■■ 56
PCBP2Q15366 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.496e-9■■■■■ 56
PCBP2Q15366 UBE2G1-202ENST00000571953 553 ntTSL 36.76□□□□□ -1.336e-9■■■■■ 56
PCBP2Q15366 LPP-213ENST00000471917 998 ntTSL 39.32□□□□□ -0.928e-7■■■■■ 56
PCBP2Q15366 UBAC2-205ENST00000460562 2350 ntTSL 213.81□□□□□ -0.24e-27■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 UBAC2-210ENST00000480738 1017 ntTSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.044e-27■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 UBAC2-208ENST00000473194 861 ntTSL 1 (best)8.3□□□□□ -1.084e-27■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-207ENST00000397105 883 ntTSL 219.9■□□□□ 0.783e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-210ENST00000428626 567 ntTSL 314.31□□□□□ -0.123e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-213ENST00000445064 669 ntTSL 514.19□□□□□ -0.143e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-206ENST00000397102 582 ntTSL 313.83□□□□□ -0.23e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.223e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.273e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-204ENST00000397099 555 ntTSL 413.1□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-212ENST00000432213 594 ntTSL 412.96□□□□□ -0.333e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-205ENST00000397101 592 ntTSL 212.96□□□□□ -0.333e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.363e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SEC13-211ENST00000431352 832 ntTSL 512.74□□□□□ -0.373e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.113e-16■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.543e-16■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.353e-16■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.233e-16■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-16■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.073e-16■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 NUTM2A-AS1-210ENST00000451940 662 ntTSL 514.35□□□□□ -0.113e-16■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.473e-16■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 GOLGA1-204ENST00000475407 4107 ntTSL 57.89□□□□□ -1.153e-16■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.743e-16■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 EIPR1-213ENST00000482570 582 ntTSL 211.86□□□□□ -0.514e-9■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 FAM122B-208ENST00000611027 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 FAM122B-207ENST00000493333 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 TMEM120A-202ENST00000431867 872 ntTSL 516.53■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 TMEM120A-204ENST00000440632 1352 ntTSL 516.21■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 TMEM120A-211ENST00000485200 590 ntTSL 39□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.098e-7■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 55.9
PCBP2Q15366 ATP11A-208ENST00000459908 4516 ntTSL 210.1□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 55.8
PCBP2Q15366 ATP11A-204ENST00000418678 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.35□□□□□ -1.234e-7■■■■■ 55.8
PCBP2Q15366 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 55.8
PCBP2Q15366 FLOT2-208ENST00000582174 703 ntTSL 318.98■□□□□ 0.636e-7■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 FLOT2-212ENST00000593158 752 ntTSL 518.17■□□□□ 0.56e-7■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 FLOT2-207ENST00000581509 426 ntTSL 217.29■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 FLOT2-211ENST00000586827 1069 ntTSL 511.11□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 KPNA1-210ENST00000494339 1923 ntTSL 220.1■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 KPNA1-203ENST00000465882 1062 ntTSL 310.5□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 KPNA1-206ENST00000476916 575 ntTSL 48.77□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 KPNA1-202ENST00000464940 582 ntTSL 47.61□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 KPNA1-208ENST00000485027 1843 ntTSL 27.16□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 KPNA1-207ENST00000482287 727 ntTSL 35.71□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 KPNA1-205ENST00000470904 3060 ntTSL 25.7□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 KPNA1-204ENST00000466923 3316 ntTSL 24.72□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.052e-25■■■■■ 55.7
PCBP2Q15366 MOSPD3-205ENST00000462372 979 ntTSL 521.17■□□□□ 0.987e-9■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.977e-9■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.857e-9■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.827e-9■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.077e-9■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 AP003108.2-202ENST00000541135 580 ntAPPRIS P1 TSL 417.9■□□□□ 0.466e-9■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 AP003108.2-206ENST00000544801 875 ntTSL 515.21■□□□□ 0.036e-9■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 AP003108.2-207ENST00000544880 591 ntTSL 414.4□□□□□ -0.16e-9■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 AP003108.2-203ENST00000536670 449 ntTSL 58.72□□□□□ -1.016e-9■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 AP003108.2-201ENST00000544025 563 ntTSL 48.52□□□□□ -1.056e-9■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 AP003108.2-208ENST00000543044 883 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.16e-9■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 AP003108.2-205ENST00000538594 569 ntTSL 47.94□□□□□ -1.146e-9■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 MKL1-208ENST00000466278 577 ntTSL 321.31■■□□□ 17e-7■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 CLASRP-207ENST00000587112 867 ntTSL 1 (best)11.79□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 55.6
PCBP2Q15366 VWCE-201ENST00000301770 3368 ntTSL 1 (best)14.12□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 55.5
PCBP2Q15366 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 55.5
PCBP2Q15366 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.551e-8■■■■■ 55.5
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 301.4 ms