Protein–RNA interactions for Protein: Q15040

JOSD1, Josephin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JOSD1Q15040 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JOSD1Q15040 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JOSD1Q15040 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JOSD1Q15040 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms