Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.9 ms