Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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FAT1Q14517 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FAT1Q14517 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAT1Q14517 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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FAT1Q14517 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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FAT1Q14517 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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FAT1Q14517 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FAT1Q14517 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FAT1Q14517 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FAT1Q14517 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FAT1Q14517 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAT1Q14517 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FAT1Q14517 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAT1Q14517 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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