Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNX3Q13761 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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