Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P11Q13670 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PMS2P11Q13670 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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