Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EIF4EBP1Q13541 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EIF4EBP1Q13541 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms