Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCGQ13326 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGCGQ13326 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCGQ13326 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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