Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIGQ13278 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIGQ13278 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIGQ13278 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIGQ13278 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIGQ13278 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIGQ13278 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIGQ13278 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIGQ13278 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIGQ13278 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIGQ13278 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIGQ13278 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIGQ13278 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIGQ13278 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIGQ13278 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIGQ13278 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIGQ13278 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIGQ13278 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIGQ13278 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIGQ13278 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RIGQ13278 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIGQ13278 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIGQ13278 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIGQ13278 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIGQ13278 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIGQ13278 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIGQ13278 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIGQ13278 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIGQ13278 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RIGQ13278 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIGQ13278 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIGQ13278 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIGQ13278 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIGQ13278 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RIGQ13278 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIGQ13278 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIGQ13278 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIGQ13278 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIGQ13278 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIGQ13278 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIGQ13278 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIGQ13278 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIGQ13278 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIGQ13278 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIGQ13278 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RIGQ13278 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIGQ13278 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIGQ13278 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIGQ13278 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIGQ13278 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIGQ13278 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIGQ13278 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIGQ13278 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIGQ13278 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIGQ13278 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIGQ13278 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIGQ13278 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIGQ13278 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIGQ13278 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIGQ13278 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIGQ13278 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIGQ13278 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIGQ13278 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIGQ13278 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIGQ13278 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIGQ13278 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIGQ13278 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIGQ13278 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIGQ13278 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIGQ13278 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIGQ13278 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIGQ13278 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIGQ13278 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIGQ13278 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIGQ13278 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIGQ13278 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIGQ13278 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RIGQ13278 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIGQ13278 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIGQ13278 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIGQ13278 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIGQ13278 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIGQ13278 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIGQ13278 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIGQ13278 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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