Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SEMA3FQ13275 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEMA3FQ13275 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3FQ13275 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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