Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HSPB3Q12988 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPB3Q12988 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPB3Q12988 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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