Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN1Q12860 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN1Q12860 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN1Q12860 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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