Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CGNL1Q0VF96 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CGNL1Q0VF96 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CGNL1Q0VF96 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms