Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOBRQ0VD83 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBRQ0VD83 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms