Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DEUP1Q05D60 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DEUP1Q05D60 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms