Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTDSPL2Q05D32 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTDSPL2Q05D32 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms