Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP4A11Q02928 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYP4A11Q02928 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 367.8 ms