Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSG1Q02413 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG1Q02413 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms