Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSF1Q00613 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSF1Q00613 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSF1Q00613 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms