Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK5Q00535 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5Q00535 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5Q00535 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms