Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC1P78364 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC1P78364 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC1P78364 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHC1P78364 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHC1P78364 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHC1P78364 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHC1P78364 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHC1P78364 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHC1P78364 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC1P78364 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC1P78364 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC1P78364 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC1P78364 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC1P78364 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC1P78364 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC1P78364 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC1P78364 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC1P78364 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC1P78364 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC1P78364 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC1P78364 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC1P78364 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC1P78364 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC1P78364 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC1P78364 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC1P78364 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHC1P78364 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHC1P78364 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHC1P78364 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHC1P78364 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHC1P78364 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHC1P78364 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHC1P78364 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHC1P78364 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHC1P78364 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC1P78364 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC1P78364 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC1P78364 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC1P78364 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC1P78364 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC1P78364 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC1P78364 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC1P78364 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC1P78364 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC1P78364 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC1P78364 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC1P78364 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC1P78364 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC1P78364 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC1P78364 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC1P78364 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC1P78364 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC1P78364 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC1P78364 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC1P78364 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC1P78364 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC1P78364 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC1P78364 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC1P78364 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC1P78364 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC1P78364 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC1P78364 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHC1P78364 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHC1P78364 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHC1P78364 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHC1P78364 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHC1P78364 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHC1P78364 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHC1P78364 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHC1P78364 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHC1P78364 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHC1P78364 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHC1P78364 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHC1P78364 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHC1P78364 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHC1P78364 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHC1P78364 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHC1P78364 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHC1P78364 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHC1P78364 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHC1P78364 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHC1P78364 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHC1P78364 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHC1P78364 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHC1P78364 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHC1P78364 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHC1P78364 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PHC1P78364 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHC1P78364 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHC1P78364 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHC1P78364 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHC1P78364 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHC1P78364 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHC1P78364 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHC1P78364 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHC1P78364 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHC1P78364 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHC1P78364 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHC1P78364 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms