Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTA1P68133 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACTA1P68133 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTA1P68133 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms