Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPNP63162 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPNP63162 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms