Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P62891 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P62891 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P62891 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P62891 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P62891 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P62891 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P62891 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P62891 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P62891 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P62891 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P62891 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P62891 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P62891 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P62891 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P62891 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P62891 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P62891 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P62891 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P62891 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P62891 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P62891 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P62891 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P62891 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P62891 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P62891 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P62891 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P62891 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P62891 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P62891 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P62891 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P62891 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P62891 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P62891 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P62891 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P62891 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P62891 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P62891 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P62891 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P62891 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P62891 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P62891 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P62891 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P62891 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P62891 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P62891 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P62891 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P62891 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P62891 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P62891 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P62891 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P62891 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P62891 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P62891 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P62891 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P62891 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P62891 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P62891 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P62891 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P62891 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P62891 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P62891 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P62891 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P62891 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P62891 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P62891 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P62891 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P62891 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P62891 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P62891 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P62891 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P62891 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P62891 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL39P62891 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL39P62891 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL39P62891 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL39P62891 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P62891 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms