Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VSNL1P62760 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSNL1P62760 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VSNL1P62760 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.4 ms