Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVS71-1P61550 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVS71-1P61550 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms