Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCCD1P59942 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCCD1P59942 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms