Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00205P59089 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00205P59089 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms