Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1H2P55055 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms