Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRADP55042 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRADP55042 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRADP55042 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRADP55042 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRADP55042 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRADP55042 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRADP55042 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRADP55042 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RRADP55042 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRADP55042 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRADP55042 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRADP55042 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRADP55042 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRADP55042 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RRADP55042 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRADP55042 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRADP55042 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRADP55042 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRADP55042 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRADP55042 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRADP55042 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRADP55042 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRADP55042 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RRADP55042 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRADP55042 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRADP55042 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRADP55042 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRADP55042 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRADP55042 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRADP55042 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRADP55042 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRADP55042 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRADP55042 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRADP55042 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RRADP55042 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RRADP55042 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRADP55042 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRADP55042 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRADP55042 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRADP55042 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRADP55042 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRADP55042 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRADP55042 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRADP55042 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRADP55042 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRADP55042 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms