Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRADP55042 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRADP55042 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRADP55042 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRADP55042 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRADP55042 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRADP55042 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRADP55042 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRADP55042 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRADP55042 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRADP55042 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RRADP55042 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRADP55042 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRADP55042 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRADP55042 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRADP55042 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRADP55042 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RRADP55042 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRADP55042 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRADP55042 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRADP55042 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRADP55042 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRADP55042 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRADP55042 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRADP55042 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRADP55042 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRADP55042 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRADP55042 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RRADP55042 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRADP55042 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRADP55042 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRADP55042 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRADP55042 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRADP55042 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRADP55042 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRADP55042 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRADP55042 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRADP55042 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRADP55042 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRADP55042 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RRADP55042 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RRADP55042 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRADP55042 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRADP55042 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRADP55042 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRADP55042 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRADP55042 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRADP55042 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRADP55042 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRADP55042 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRADP55042 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRADP55042 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRADP55042 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms