Protein–RNA interactions for Protein: P54652

HSPA2, Heat shock-related 70 kDa protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA2P54652 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HSPA2P54652 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HSPA2P54652 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
HSPA2P54652 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
HSPA2P54652 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
HSPA2P54652 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
HSPA2P54652 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
HSPA2P54652 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
HSPA2P54652 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
HSPA2P54652 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HSPA2P54652 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HSPA2P54652 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HSPA2P54652 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
HSPA2P54652 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
HSPA2P54652 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
HSPA2P54652 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
HSPA2P54652 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1670.8 ms