Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFIP1P53367 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP1P53367 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms