Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KPNA2P52292 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms