Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3P48764 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms