Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMTP48728 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMTP48728 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMTP48728 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMTP48728 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMTP48728 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMTP48728 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMTP48728 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMTP48728 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMTP48728 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMTP48728 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMTP48728 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMTP48728 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMTP48728 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMTP48728 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMTP48728 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMTP48728 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMTP48728 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMTP48728 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMTP48728 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMTP48728 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMTP48728 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMTP48728 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMTP48728 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMTP48728 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMTP48728 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AMTP48728 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMTP48728 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMTP48728 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMTP48728 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMTP48728 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMTP48728 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMTP48728 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMTP48728 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMTP48728 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMTP48728 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMTP48728 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AMTP48728 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMTP48728 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMTP48728 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMTP48728 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AMTP48728 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMTP48728 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AMTP48728 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMTP48728 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMTP48728 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMTP48728 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMTP48728 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMTP48728 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMTP48728 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMTP48728 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMTP48728 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMTP48728 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMTP48728 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMTP48728 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMTP48728 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMTP48728 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMTP48728 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMTP48728 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMTP48728 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMTP48728 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMTP48728 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMTP48728 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMTP48728 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMTP48728 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMTP48728 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMTP48728 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMTP48728 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMTP48728 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMTP48728 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMTP48728 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMTP48728 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMTP48728 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMTP48728 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMTP48728 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMTP48728 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMTP48728 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMTP48728 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMTP48728 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMTP48728 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMTP48728 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMTP48728 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMTP48728 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMTP48728 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMTP48728 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AMTP48728 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMTP48728 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms