Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARCN1P48444 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARCN1P48444 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms