Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQLP46063 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQLP46063 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQLP46063 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQLP46063 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQLP46063 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQLP46063 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQLP46063 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQLP46063 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQLP46063 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQLP46063 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQLP46063 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQLP46063 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQLP46063 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQLP46063 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQLP46063 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQLP46063 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RECQLP46063 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RECQLP46063 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RECQLP46063 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RECQLP46063 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RECQLP46063 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RECQLP46063 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RECQLP46063 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RECQLP46063 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQLP46063 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQLP46063 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQLP46063 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RECQLP46063 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RECQLP46063 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RECQLP46063 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RECQLP46063 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQLP46063 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQLP46063 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQLP46063 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQLP46063 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQLP46063 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQLP46063 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQLP46063 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQLP46063 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQLP46063 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQLP46063 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RECQLP46063 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RECQLP46063 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RECQLP46063 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RECQLP46063 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RECQLP46063 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RECQLP46063 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RECQLP46063 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RECQLP46063 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RECQLP46063 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RECQLP46063 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RECQLP46063 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RECQLP46063 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RECQLP46063 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RECQLP46063 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RECQLP46063 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQLP46063 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQLP46063 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQLP46063 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQLP46063 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQLP46063 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQLP46063 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQLP46063 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQLP46063 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RECQLP46063 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQLP46063 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQLP46063 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQLP46063 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQLP46063 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RECQLP46063 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQLP46063 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQLP46063 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQLP46063 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQLP46063 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RECQLP46063 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQLP46063 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQLP46063 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQLP46063 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQLP46063 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQLP46063 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RECQLP46063 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RECQLP46063 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RECQLP46063 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RECQLP46063 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RECQLP46063 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RECQLP46063 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RECQLP46063 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RECQLP46063 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RECQLP46063 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RECQLP46063 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RECQLP46063 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RECQLP46063 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RECQLP46063 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RECQLP46063 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RECQLP46063 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RECQLP46063 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RECQLP46063 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RECQLP46063 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RECQLP46063 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.2 ms