Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECI1P42126 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECI1P42126 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECI1P42126 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECI1P42126 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECI1P42126 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECI1P42126 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECI1P42126 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECI1P42126 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECI1P42126 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECI1P42126 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECI1P42126 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECI1P42126 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECI1P42126 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECI1P42126 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ECI1P42126 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECI1P42126 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECI1P42126 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECI1P42126 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECI1P42126 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECI1P42126 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECI1P42126 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECI1P42126 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECI1P42126 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECI1P42126 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECI1P42126 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECI1P42126 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECI1P42126 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECI1P42126 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECI1P42126 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECI1P42126 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECI1P42126 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ECI1P42126 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECI1P42126 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECI1P42126 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ECI1P42126 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECI1P42126 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECI1P42126 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ECI1P42126 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECI1P42126 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECI1P42126 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECI1P42126 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECI1P42126 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECI1P42126 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECI1P42126 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECI1P42126 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECI1P42126 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECI1P42126 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECI1P42126 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECI1P42126 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECI1P42126 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECI1P42126 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECI1P42126 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECI1P42126 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECI1P42126 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ECI1P42126 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECI1P42126 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECI1P42126 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ECI1P42126 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECI1P42126 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECI1P42126 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECI1P42126 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ECI1P42126 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECI1P42126 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECI1P42126 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECI1P42126 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECI1P42126 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECI1P42126 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECI1P42126 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECI1P42126 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECI1P42126 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECI1P42126 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECI1P42126 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECI1P42126 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECI1P42126 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECI1P42126 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECI1P42126 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECI1P42126 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECI1P42126 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECI1P42126 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECI1P42126 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECI1P42126 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECI1P42126 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECI1P42126 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECI1P42126 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECI1P42126 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECI1P42126 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECI1P42126 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECI1P42126 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECI1P42126 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECI1P42126 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECI1P42126 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECI1P42126 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECI1P42126 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECI1P42126 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECI1P42126 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECI1P42126 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ECI1P42126 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECI1P42126 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECI1P42126 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms