Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARL3P36405 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARL3P36405 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARL3P36405 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARL3P36405 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARL3P36405 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARL3P36405 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARL3P36405 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARL3P36405 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARL3P36405 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARL3P36405 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARL3P36405 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARL3P36405 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ARL3P36405 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL3P36405 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL3P36405 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL3P36405 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL3P36405 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL3P36405 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL3P36405 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL3P36405 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL3P36405 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL3P36405 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL3P36405 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL3P36405 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL3P36405 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL3P36405 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL3P36405 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL3P36405 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL3P36405 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL3P36405 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL3P36405 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL3P36405 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL3P36405 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL3P36405 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL3P36405 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL3P36405 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL3P36405 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL3P36405 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL3P36405 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL3P36405 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL3P36405 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL3P36405 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL3P36405 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL3P36405 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL3P36405 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL3P36405 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL3P36405 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL3P36405 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL3P36405 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL3P36405 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL3P36405 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL3P36405 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL3P36405 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL3P36405 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL3P36405 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL3P36405 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL3P36405 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL3P36405 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL3P36405 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL3P36405 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL3P36405 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL3P36405 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms